影响鸡群免疫的因素很多，都会对免疫的效果有影响。从影响鸡群免疫效果的因素来分析免疫失败的原因主要有以下：
(1)母源抗体的干扰 主要是免疫过早或过晚。
(2)疫苗方面的因素 主要包括①疫苗质量不好；②各种原因造成疫苗失效或效力下降(如保存不当、受高温日光直射，pH值不当，密封不严，稀释后放置过久，稀释液中含有消毒剂或金属离子等)；③稀释方法不当；④接种方法不当（特别是饮水免疫和气雾免疫没有按要求去严格执行）；⑤接种剂量不够或接种质量不高；⑥选择疫苗的抗原和鸡群中流行的毒株（菌株）的抗原型或血清型不符。
(3)联合使用了具有干扰作用的疫苗或使用这些疫苗之间间隔时间不适当 特别是具有呼吸道症状的疾病的活疫苗。
(4)早期感染 由于环境消毒不严格或环境中存在野毒，使鸡只在免疫力尚未完全确立起来前，就感染了环境中的病毒，导致免疫失败。鸡的法式囊、马立克病的免疫失败，早期感染是其免疫失败的重要原因之一。
(5)免疫抑制因子的出现 如法式囊病、马立克病、霉菌毒素、中毒病和球虫病等。
(6)病毒的抗原性的变异或超强毒株的出现如超强新城疫病毒、超强马立克病毒、传染性法式囊血清Ⅰ型变异株等。
(7)鸡体的自身营养状况差
(8)饲养管理条件差 鸡舍的环境条件恶劣等一些应激因素，也是造成免疫失败不可忽视的原因。
不同的地区疾病流行特点各异，因此没有固定的免疫程序，鸡场要根据当地疫病流行情况和本场实际，制定科学合理的免疫程序。有条件的鸡场要进行抗体监测，根据抗体消长情况适时免疫是最科学的。不具备条件的鸡场应参照提供雏鸡单位的免疫情况和本场的经验制定合理的免疫程序。 根据近些年传染病发生情况，我向大家推荐一个蛋鸡基本免疫程序，在应用时参考，不可照搬。肉种鸡的免疫程序和蛋鸡基本相同，不同的是要免疫病毒性关节炎，一般在7日龄和56日龄免疫两次，此外在120日龄左右种鸡免疫法式囊灭活苗，以提高后代雏鸡的母源抗体。
日龄 疫病名称 接种疫苗名称 接种方法 注意事项及备注
1 马立克氏病 HVT冻干苗或液氮苗 皮下注射 液氮苗用于高发生地区
7－10 新城疫/传支 新城疫－H120或克隆30＋Ma5 滴鼻点眼 肾型传支发生地区使用肾型传支苗
10－13 传染性法式囊病 中等毒力苗 滴鼻点眼 弱毒苗首免应提前到7－10日龄
22－25 新城疫/传支 新城疫－H120或克隆30＋Ma5 滴鼻点眼 加半剂量新城疫灭活苗皮注射
26－28 传染性法式囊病 中等毒力苗 饮水或点眼 使用弱毒苗需再加强免疫1次
30 鸡痘 鸡痘冻干苗 刺种
35－42 传染性喉炎 弱毒苗 滴鼻点眼 毒力较强，谨慎使用
70－80 新城疫 I系或IV系或克隆30 注射 I系注射外，其它可饮水或气雾
90－100 喉气管炎 活苗 点眼滴鼻
鸡痘 冻干苗 刺种
120－140 新城疫、减蛋综合症、传支 三联灭活苗 肌肉注射 新城疫I系每70天饮水一次
