正常的平菇菌丝浓密洁白，呈扇形向前发展，而有的菌丝呈绳索状或束状向前生长，称之为“菌丝索”。“菌丝索”形成的主要原因是菌种已退化，发生“菌丝索”现象是菌种严重退化的一种表现。另外，配料过干过湿或不匀，都能引起“菌丝索”的产生。
防治方法：退化的一、二、三级菌种内都能发现“菌丝索”，买菌种时要认真检查，不要使用已退化的菌种，用退化的菌种栽培平菇，不但不易管理，而且产量也低；拌料时要充分搅拌均匀，常压灭菌时，要避免锅内的冷凝水进入料袋内。
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