番茄种子在播种前催芽，可促使幼胚迅速发育，有缩短种子萌发时间和促进出苗整齐、迅速的作用。在催芽过程中，要提供适宜的温度、水分和空气环境。番茄种子催芽的适宜温度为25～30℃，相对湿度为90％以上。在催芽过程中，应经常检查和翻动种子，每天要按时用30℃左右的温水冲洗种子1～2次，甩干种子表面水分或稍晾后继续催芽，以便保持湿度，更换空气，促使所有种子发芽均匀。在适宜的条件下，经2～3天番茄种子即可发芽，常用的催芽方法有以下几种：
1、瓦盆催芽法
将浸种消毒后的种子洗净，用干净的湿纱布包好，放入垫有稻秸的瓦盆里，以免底部积水而霉烂种子，上面盖上潮湿的麻袋或毛巾，以保持湿度，然后把瓦盆放在压火道、热坑头或催芽箱内催芽。
2、掺沙催芽法
将浸种消毒后洗干净的种子与洗干净的河沙按1：1.5的比例拌匀，装入瓦盆内，盖上湿沙或湿布，然后放在适温处催芽。
3、电热控温催芽法
通过在催芽箱内安装电子控温仪控制温度，并保持适宜的空气湿度。
对催芽温度的掌握，开始要稍低，以后逐渐增高，当胚根将要突破种皮时再降低（降至20～24℃），促使胚根粗壮。当70％左右的种子胚根露白时，应将种子用湿毛巾包好放入冰箱内，温度在5℃左右并保持适宜的湿度，待条件良好时，再行播种。