一、后期管理辣椒的生育期长，又是多次采收，在施足基肥的基础上，还需分次追肥。只要能卖掉，辣椒在早期要采收嫩果。当辣椒刚刚长成，不在膨大时，就可以采收上市。这样可以减少果实对养分的消耗，提高后续花（果）的正常发育，提高产量。盛果期要充分供给水分。夏季高温季节要夜灌，降温保苗，多雨季节要及时排水防涝。
二、后期病虫后期主要是蚜虫、瓜食蝇、白粉虱、枯萎病。蚜虫：每亩用鲜人尿25公斤加水25公斤，再加入0.2%的中性洗衣粉，晴天上午10点喷洒，防治效果可以达95%。或者用虫淋、一遍净、啊维菌素等药剂防治。瓜食蝇：用50%敌敌畏乳油1000倍液、2.5%溴氰菊酯3000倍液。白粉虱：用25%扑虱净乳油、2.5%天王星乳油、2.5%功夫乳油等。枯萎病：用25%笨来特或50%多菌灵粉剂等灌根。如果发现病株应立即拨除烧毁。防治药剂：百菌清、疫克、波尔多液、农利灵、安克、西先吗、乙磷铝、杀毒矾或金雷多米尔喷施，病叶摘除带走销毁。