黄鳝常年生活在环境因素复杂的水体，经常受到病毒、细菌及寄生虫等病原体的侵害。黄鳝在饲养过程中，遇到水温激变，溶氧不足，水酸性过重，饲养管理不善，如食料不足，营养不良，或投喂了腐烂变质的饲料，水质恶化等使其生理状况紊乱，鳝体衰弱，抵抗力差，严重者常会引起大批死亡。即使不死，也会直接影响黄鳝的生长发育。也有的是由于放养密度过大，或人为操作粗放使鳝体受伤等。外界环境给病原体创造了良好的繁殖场所，病原体乘虚而入鳝体。引起鳝病的原因较多，归纳起来是机体和外界两方面互相作用的结果。
人工饲养黄鳝应本着无病早防、有病早治、防重于治的原则。做好防病工作，主要要有专人负责对鳝池管理。鳝种放养前要对鳝体用8～10毫克／千克高锰酸钾和2％～3％食盐水等药物进行体外消毒，每平方米鳝池用50～100克生石灰水全池泼洒，待5～7天后，药力消失后再投入放养鳝种。要认真观察水质变化改善水体环境，要视鳝种的忍耐程度和水温高低来灵活掌握。检查时如发现在池的水体中黄鳝活动较迟缓，有不安表现时应捞出水面观察，做好记录，对已发病的鳝池要用漂白粉10克溶化在5千克水中，泼洒消毒。做好病鳝的隔离工作，杜绝鳝病发生和蔓延。若有病死鳝鱼，应挖坑深埋，切勿乱丢，以防疫病传播蔓延。
