金鱼与水的关系，如同人不能离开空气一样，水质不宜或水源被污染，则金鱼不能正常生活甚至死亡。人工饲养金鱼的水源选择非常重要。
（一）地下水
井水、泉水等均为地下水，其中含钙、镁等矿物质较多，硬度较大，属于硬水。地下水源污染较少，水质远较天然水稳定，但水温常常偏低，故需经过充分的日光照射，升温后方可使用。北京地区各公园及过去的宫庭中饲养金鱼、以玩赏为主要目的者，５０年代以前，均采用地下水源。很多北京金鱼饲养专家认为，采用地下水源饲养金鱼，可以获得体色艳丽的金鱼群体，以提高金鱼的观赏价值。
（二）天然水
自然界的河水、湖水等均属于天然水源，其水质较温和，浮游生物较多，肥分较大，含氧量亦较丰富。但这类水中易被污染，含杂质多，水色常较浑浊，一经日晒水温极易升高，致使有机物质大量分解，一些浮游生物死亡而腐败也引起水体迅速变质，对金鱼生活不利甚至造成鱼群死亡。在工厂密集的城镇或地区，常有大量工业废水排入江河及湖泊，致使很多有毒的化学物质（如硫、铅、磷、酸等）危害鱼体甚致引起死亡。因此，利用天然水饲养金鱼，需及时对水源的水质进行检测，随时掌握水质变化情况，并进行水质处理，才能保证所饲养金鱼的正常生活和繁殖。
（三）自来水
自来水是经过净化处理的软水。从６０年代初，北京各公园饲养金鱼开始采用自来水。自来水在净化过程中，由于杀菌消毒和沉淀浑浊物质，要加入适量的氯、漂白粉、明矾等药剂，它们虽然对人类无害，但对金鱼饲养不利。
氯是一种有刺激气味的气体，易溶于水中，能使金鱼的鳃部受到侵蚀，所以在使用自来水饲养金鱼时，必须首先将氯去掉，最简便的除氯法，是先将自来水置于广口清洁的容器中，晾晒１～３天，使氯气充分挥发，此过程俗称晾水，也称去氯，氯气挥发后的水，称为熟水，适于饲养金鱼。如应急使用自来水放养金鱼，也可在新放出的自来水中加入微量的次亚硫酸钠（海波），进行去氯，其用量为每立方米水中加入小米粒大小的次亚硫酸钠不超过１００粒。
（四）雨水
雨水中含有亚硫酸等有害气体，尤其是城市上空常含有碳、氰、硫等有毒化合物，这些物质在高空溶于雨水中，对金鱼饲养非常不利，若饲养金鱼的盆（池）中混入大量雨水，则会使金鱼大量死亡。因此，大雨之后，在饲养金鱼的盆池中需及时排除表层水（雨水多浮于上层）。
饲养金鱼选择水源，需从水源及水质的物理、化学和生物三方面因素考虑，适宜的水质和水温是金鱼生活和繁殖的重要关键。金鱼是重要观赏鱼类，它对水质要求与食用鱼相比有较大的区别，一般要求水质清新、中性或弱碱性为好，酸性水不适宜饲养金鱼。地下水含盐量不高于１％，尚可使用。
总之，不含有大量矿物质的水，一般水生动物能正常生活的水，都可用来饲养金鱼。无论选用哪种水源，不宜轻易更换，否则会对金鱼的生活及繁殖产生较大影响，甚至造成鱼群死亡。必须更换水源时，最好采取渐进逐步更换的方法，以利于金鱼逐步适应。
