鱼生活在水中，一旦发生疾病，在治疗和隔离上均较困难，因此，早期预防是防止鱼病的重要措施，每个养鱼爱好者应时刻想到金鱼可能发病，争取将病因消除于发病之前，所以消毒工作就显得十分重要。
一、养鱼容器消毒
鱼缸、鱼盆要经常刷洗消毒，新买来的鱼缸、鱼盆等容器要经常清洗，对未用过的容器和刚刚养过病鱼的容器，使用前必须消毒。发生过传染性病的容器用百万分之五或百万分之十浓度的漂白粉溶液消毒。发生过寄生虫病的容器用4%―8%硫酸铜溶液消毒。放药后经5―7天，将缸水放掉即可养鱼。远征消毒液2号可用于传染病和寄生虫病的消毒。
二、鱼体消毒
即使外表看起来十分健康的金鱼也或多或少有一些病原体。消毒过的鱼缸，若放养未经消毒的鱼体，就等于没有消毒。常用消毒药液为2%―3%盐水或2%―3%呋喃西林水溶液以及1%浓度高锰酸钾溶液，对鱼体进行药浴，一般药浴时间为5分钟―10分钟，在实际操作中要根据鱼在药液中的活动状态，来确定药浴时间，千万不要等到鱼翻了肚子再取出。用远征消毒2号进行鱼体消毒能起到很好的消毒目的。
三、饲料消毒
从野外天然水中捞取的水蚤、浮萍等，有可能将某些病原体带入鱼缸中，因此一般新鲜的食料，在投喂前要进行消毒。常用10%高猛酸钾溶液浸洗10分钟或20%漂白粉溶液浸洗10分钟或30%漂白粉溶液浸洗5分钟，在用水冲洗后再投喂，用远征2号消毒液可起到很好的消毒效果。
四、养鱼工具消毒
经常使用的养鱼工具，每天用完要用清水或20%的呋喃西林浸泡半个小时。有的可置于阳光下经紫外线消毒。远征2号消毒液也能用做养成鱼工具的消毒。
五、其他预防措施
购入鱼时，不管新买来的鱼是否有病，都应隔离10天以上，确保没有疾病时，才能与其它鱼养在一起。当发生鱼病时，应立即将发病个体捞出，隔离饲养，对症治疗。
