工厂化养鱼放养密度大、生长速度快、养殖产量高，对水交换的要求很高。调节好水质，不仅能够节约水资源，还能大大降低用电量，进而降低养殖成本，提高生产效益。在水质调控方面一般使用以下的方法。
1、选用良好的水源
水源必须洁净、无污染，符合国家渔业用水标准。利用地下海水还必须保证水质良好、盐度合适，并经过充分曝气后再使用。
2、严格处理
海水必须经过沉淀、砂滤、网滤等程序，以保证水质清洁、不含敌害生物和病原菌，有条件还可以对海水进行紫外线照射消毒、臭氧消毒等。
3、机械增氧
机械增氧是增加水体溶解氧、改良水质的重要措施之一，常用机械为各种增氧机、空压机、液态氧充气装置等。要根据不同情况选择不同的增氧设施，设置合理的数量。增氧机的开启时间，应根据池水情况，尤其是放养的密度、溶解氧水平、水流量的多少、添换水的情况、池底污染状况等确定充氧的时间和气量的大小。
4、换水和清污
根据养殖操作规程和具体生长情况，合理调整换水量。同时要及时清除池底和池壁的残饵、粪便、附着物等污物，保持池底的清洁，减少污染。换水或流水要采取有效措施，保证池内、外的水温、盐度等理化指标的一致。
5、合理养殖密度
放养密度要适宜，必须根据池水交换、产量设计、养殖技术、病防措施、水源水量和质量等具体情况确定合适的放养密度，若放养密度过大，容易造成投饵量和排泄物的增多，使池水溶氧量降低，甚至带来水质恶化。养殖密度的确定应该以质量优、效益高、产量多为原则。
6、加强投饵管理
不使用鲜活饲料及自制的干、湿配合饲料，推广使用对水产动物和人类安全的优质配合饲料，包括酶制剂和微生态制剂，不仅能提高饲料利用率，促进养殖生物的生长，还能够减少残饵的数量，减轻水质的污染，提高养殖用水的质量，降低养殖成本。所使用的配合饲料一定要符合《NY5072-2002无公害食品 渔用配合饲料安全限量》的要求。
