一、选用高效、低毒、低残留农药。比如扑虱灵、比双灵、杀螟松、杀虫双、乐斯本、灭幼脲、生物Br、稻瘟灵、多菌灵、叶枯灵、三环唑等。严禁使用对于鱼类高毒、高残留的农药，如甲氰菊脂、喹恶硫磷、来福灵、菊马乳油和国产醚、菊酯类农药等。尽师资地性质相应的农药，如叶枯灵与叶青双、多菌灵与井冈霉素轮换交替使用，还要综合运有混配和兼治技术，以减轻病虫的抗药性。
二、严格控制用药量。药量不宜过大，以免毒害鱼类。每亩每次常用药量为：25％虱灵20-25克，80％比双灵35克，50％杀螟松乳油25-30毫升，18％杀虫双水剂200-300毫升，生物Bt菌粉50克，50％稻丰散乳油100-150克，20％三环唑75-100克。
三、掌握安全施药方法。养鱼稻田常用的安全施药方法有下列四种：1.深水施药。将稻田水加深至7-10厘米，把药液尽量喷洒在稻叶上。2.排水施药。把稻田水慢慢放掉，使鱼类通过鱼沟全部集中到鱼函中，然后向大田中施药。待农药毒性降解后，再往稻田里加水至正常深度。3.分段施药。先在稻田的某一段施药，让鱼类逃避到尚未施药的田段中，隔天再在未施药的田段中施药。4.隔时施药。利用水稻不同品种生育期的差异，将几个品种栽植到同一块稻田中，在水稻的某一生育期施药，这样在时间上就自然错开了。
四、适时施药。鱼类在投放稻田前，要对水稻秧苗和移栽后的幼苗施药一次。具有内吸作用的杀菌剂，宜在水稻发病初期施药。易溶解的扑虱灵、杀螟松、稻丰散等，宜在害虫盛发期施药。残效期较长的农药如三环唑等，应在水稻抽穗前施药。对于某些害虫可适当放宽防治指标，推迟防治适期。比如稻飞虱的防治指标，可由原来的每亩20万头放宽到25-30万头，这样既可获得较好的防治效果，又可减少防治次数，一举两得。施药时间一般安排在上午9时或下午4时。粉剂农药宜在上午施，水剂、乳油农药下午施。施经后必须密切关注鱼类活动情况，倘若一旦发现鱼类有中毒症状，应立即加注新水，或边灌水边排出稻田里的药水，以避免鱼类中毒死亡。
