肉眼检查(目检)，是目前生产上用于诊断鱼病的主要方法之一，重点检查体表、鳃、内脏三部分，方法如下：
一、体表：
将病鱼置于盘中依次从头部、嘴、眼、鳃盖、鳞片、鳍等顺序仔细观察。
(一)检查有无大型病原体。如水霉、嗜子宫线虫、锚头蚤、鱼鲺、钩介幼虫等。
(二)根据症状辨别病原。如车轮虫、鱼波豆虫、斜管虫、三代虫等寄生，一般会引起鱼体分泌大量粘液，有时微带污泥，或是头、嘴及鳍条末端腐烂，但鳍条基部一般无充血现象。
双穴吸虫病，则表现出眼睛混浊，有白内障。细菌性赤皮病，则鳞片脱落、皮肤充血。疖疮病则在病变部位发炎、脓肿。白皮病的病变部位发白，粘液减少，用手摸时有粗糙的感觉。腐皮病的病变部位产生侵蚀性的腐烂等病状。发现病鱼肌肉、鳃盖和鳍基充血发红，可初步诊断为病毒性出血病或暴发性鱼病，病鱼尾巴极度上翘、颅脑发黄，在水中狂游打圈，则为疯狂病。但有些病状，包括体表、鳃、内脏等的症状，在几种不同的鱼病中基本上是一样的，如鳍基充血和蛀鳍的赤皮病、烂鳃病、肠炎病及一些其他细菌性鱼病；又如在大量车轮虫、鱼波豆虫、斜管虫、小瓜虫、三代虫等寄生时，都会在体表、鳃部有较多的粘液，所以应把观察到的病状，联系起来加以分析。
二、鳃
鳃部检查，重点是鳃丝。
(一)首先要注意鳃丝是否张开。
(二)将鳃盖剪去，观察鳃丝的颜色是否正常，粘液是否正常，粘液是否较多，鳃丝末端是否有肿大发白和腐烂现象。
如：患细菌性烂鳃病，则鳃丝末端腐烂，粘液较多。鳃霉病则鳃片的颜色较正常鱼的鳃片白，略带血红色小点，如患鱼波豆虫病、鳃隐鞭虫病、车轮虫病、斜管虫病、指环虫病等寄生虫性疾病，则鳃丝上有较多粘液。如患中华蚤病、指环虫以及粘孢子虫等寄生虫病，则常表现鳃丝肿大，鳃盖张开等症状。
又如：亚硝酸中毒，鳃丝颜色变为紫红色等。
三、内脏
将一边的腹壁剪去(注意勿损坏内脏)，从肛门部位向左上方沿侧线剪至鳃盖后缘，向下剪至胸鳍基部，除去整片侧肌。
(一)观察是否有腹水和肉眼可见的寄生虫。
肉眼可见的寄生虫有：线虫、舌状绦虫等。
(二)仔细观察各内脏的外表(颜色、大小、位置、有无出血、充血等)，看是否正常。
肝胰脏正常颜色为粉红色，外表光滑。
肠正常时，因其中有食物粪便存在，呈暗褐色，边缘粉红色，鳔白色。
(三)将内脏取出、分离、观察其内部症状。
1．剪断靠近咽和肛门部位的肠，取出内脏。
2．将内脏(肝、胆、脾、心脏等)，逐个分离，观察质地，内部的症状，颜色。
3．分离肠道，将肠道分为前、中、后三段，轻轻将肠道中的食物、粪便去掉，然后观察。
①观察是否发生充血或肉眼可见的寄生虫。如：肠炎病，会表现肠壁充血、发炎、溃疡。吸虫、涤虫、线虫等肉眼容易看见。
②观察肠壁是否有小寄生虫及肠壁的质地等。
如：艾美虫病和粘孢子虫病在肠壁上一般有成片或稀散的白点。
饲料营养缺乏等原因可产生肠壁变薄，质地脆的症状。
4．其它内脏器官，如在外表上未发现病状，可不再检查。
检查注意事项：
1 .用于检查的鱼，要用活鱼或刚死不久的鱼。检查时要保持鱼体体表湿润，应放在盛水的容器中，路程远的要用湿布包裹。解剖时要保持器官的完整性并防止相互污染，同时要做好记录，以提高诊断的准确性。
2．有时一种病有几种病状同时表现出来，如肠炎病，就有鳍条基部充血、蛀鳍、肛门红肿、肠壁充血等病状；有时一种病状在好几种病中同样出现，如体色发黑、鳍条基部充血、蛀鳍等，这些病状为细菌性赤皮病、疖疮病、烂鳃病、肠炎病等所共有。
检查时要注意区别、总结、分析。
