长大量的藻类植物，会使水质恶化，影响鱼类生长，甚至引起鱼儿死亡。现介绍几种常见有害藻的防除方法：
水网藻 多发于水质较肥的浅水鱼塘中，旺盛的丝状藻体集结如网带，鱼苗误入网中常会因呼吸困难和无法摄食而死亡。防除方法；放养鱼种前用生石灰清塘，每亩水深1米的水体用量为7.5％千克。发生该藻时，可用硫酸铜溶液泼洒池塘水面，使池水的硫酸铜浓度为1.5毫克／升。
水绵、双星藻、转板藻 旺长时漂浮于水中，形成团团乱丝，影响水温的升高和氧气的溶解，且大量消耗养分使池水变瘦，影响鱼类正常生长。防除方法：放养鱼种前用生石灰清塘，每亩水深1米的水体用量为5千克。发生该藻时，可用硫酸铜溶液全池泼洒，使池水的硫酸铜浓度为1.5毫克／升，2小时后换入1/3的新水；或每亩水深1米的水体用150-200克扑草净拌湿细土撒于藻体上。
铜绿微囊灌、水华微囊藻 藻体蛋白质迅速分解可产生大量的有害腐败物质，从而加重池水缺氧，引起鱼类窒息死亡。防除方法：放养鱼种前每亩水深1米的水体施用基肥（有机肥）500-1000千克，高温季节鱼池要常换新水。该藻类发生初期，可用硫酸铜溶液全池泼洒，也可每亩水深1米的水体放养罗非鱼1000尾。
