用药物将鱼麻醉，使其呈类似休眠状态，不能游泳和跳跃，呼吸频率减慢，代谢降低，耗氧减少，这样可以大密度长途运输活鱼。选用药物的原则是对鱼药效高；对人无害；易缓解苏醒；价廉易购；使用方便，易溶于水；低温下有效。这里简单介绍几种在活鱼运输中的麻醉剂及其用法。
1、巴比妥钠把活鱼放入13.3×10-6的巴比妥钠溶液内运输，不久鱼就呈昏迷状态，腹部向上，呼吸减慢，不游动，在水温10摄氏度时，能麻醉10多个小时，放入清水后5―10分钟就能缓解苏醒。
2、苯巴比妥纳可按每公斤体重1.11毫升肌肉注射。鱼经麻醉后，仰浮于水面，呼吸缓慢。如途中发现鱼有跳跃冲撞时，表示药量不足，应再予以注射适当药剂，达到麻醉为止。用此法运输，药效时间可达8―20小时。
3、乙醚(或95%酒精)用药棉沾乙醚(体重2-3公斤鱼用0.5-0.8毫升)塞入鱼口内，2-3分钟后鱼就麻醉，再将鱼放入清水桶里或包在水草中或湿布内运输，一次可麻醉2-3小时，效果亦好。
