控制与消灭鱼病，应从冬、春季节开始，抓住关键季节，事半功倍。冬季万物萧条，在养殖环境里很多生物处于保命阶段。躲藏在淤泥中的有害生物对外界驱杀力的抵御能力极低，杀一当千。在开春惊蛰后，万物复苏，逐渐活跃，生长旺盛，直到来势凶猛。在它们生长旺盛期驱杀，难度极大。消灭鱼病，最佳时期是冬末春初。
淤泥是肥水的肥料库。淤泥又是水中有害物质的大本营，是有害生物躲藏的窝点。淤泥超过15厘米深以后，容易造成水体过肥，养鱼容易泛池，缺氧死鱼；淤泥过深鱼病孳生过猛，危害很大。例如淤泥中的大量有机酸、氨，特别是毒性很大的硫化氢等有害物质使水体的酸碱度变坏，pH值下降。再如淤泥中的有害病菌、寄生虫及致病微生物都是暴发鱼病的极大隐患。
清除过多淤泥后，使用下列方法杀灭泥中有害生物： 浅水消毒除害，从池底排水，留水几厘米深，每667平方米可用生石灰100千克。用漂白粉清塘，每667平方米用1.5～2.5千克。如果含氯量为20%左右的漂白粉，应加量多放，全池泼洒。 用以上两药物清塘要注意在药性消失后才能放鱼，否则会造成死亡。一般地讲，生石灰清塘7～10天后药性消失，漂白粉清塘3～5天后药性消失。最保险的办法是清塘后，在池中放试水鱼。即用小网箱架于池中放上数条小鱼，如果生活得很好，说明药性已消失了；如果鱼受不了，说明药性未尽，应迟一两天再放。
放鱼时，还要用高锰酸钾10～20克/立方米，或漂白粉10～20克/立方米，浸泡鱼种10～30分钟，进行鱼体消毒（不能用金属容器消毒）。
