设施蔬菜单一连作种植和不合理的肥水管理导致土壤生物学质量急剧下降，生物多样性降低，容易导致土传病害尤其是根结线虫发生严重，对蔬菜的产量和品质造成很大影响。根结线虫在我国温室、大棚的黄瓜种植区普遍发生，一般造成减产20%～30%，甚至绝收，并且还容易引发其他病虫害，降低黄瓜抗性，直接影响了菜农的收入。根结线虫病除危害黄瓜外，还能危害番茄、茄子、白萝卜、菜豆、芹菜、甘蓝、辣椒、大白菜等20多种蔬菜。防治黄瓜根结线虫要以农艺管理和物理防治为主，化学药剂防治为辅。
一、农艺管理 栽培管理 1.选择耐或抗线虫品种，黄籽南瓜嫁接育苗。2.选用无病土壤育苗，施用充分腐熟的有机肥或生物有机肥育苗。3.切断线虫寄主，与非寄主植物进行轮作、休闲处理。种植玉米或者在4月份套种苦瓜、茼蒿和万寿菊等作物，通过根系分泌物抑制线虫。4.清洁生产。根结线虫生长发育和繁殖必须在活体寄主中进行，在前茬收获后及时、彻底清除病株、病根残体，将病根晒干集中烧毁或进行高温堆肥，杀灭虫卵。5.合理水肥调控。土壤相对湿度40%～70%利于线虫繁殖和生长发育，在线虫活动初期适当淹水灌溉创造淹水条件抑制线虫。合理施用有机肥，化肥氮磷钾养分配比要均衡，适当补充中微量元素肥料，促进根系发育，通过壮根缓解线虫的危害。选用抗线虫微生物菌剂或生物有机肥，改善土壤根际微生态平衡，趋避或抑制根结线虫。
二、物理防治 根结线虫的发育适宜温度为20℃～30℃，致死温度为55℃，需5～10分钟。采取热处理如蒸汽或太阳能高温覆膜消毒等杀死线虫。夏季休闲季节结合高温闷棚，采用秸秆发酵的高温或秸秆-石灰氮太阳能消毒处理。通过作物秸秆高温发酵，改善土壤环境、控制土传病害。按定植行距开沟，每亩集中施入3500～4000公斤麦秸或玉米秸，撒施碳铵50公斤，然后将所施的鸡粪等有机肥和部分表土混匀。在沟内秸秆之上培成垄，盖地膜，灌透水，闷棚，20～30天揭去地膜，准备定植。秸秆-石灰氮太阳能处理是在休闲季7月初翻地，按石灰氮60公斤/亩和秸秆600公斤/亩的量施入土壤，挖沟起垄。用塑料薄膜将地表密封后进行膜下灌溉，将水灌至淹没土垄，而后密封大棚进行闷棚，持续15～20天，定植前一周揭开薄膜散气。采用秸秆-石灰氮处理后，尿素追肥时间要推迟1周左右，追施量减少5%～10%，以发挥石灰氮和尿素的协同供肥作用。
三、药剂防治 化学药剂对瓜类蔬菜会产生药害，只在线虫严重发生时使用，以保证黄瓜无公害生产。施药后必须覆土再种植，不能使种子或作物根系直接接触药物。常用药剂有福气多、阿维菌素和威百亩等，具体用法如下：1.1.5%的噻唑膦颗粒剂(福气多)具有触杀和内吸双重作用，每亩1.5～2公斤，拌细土40～50公斤，撒于土壤表面，翻土20厘米。2.1.8%的阿维菌素乳油，抗生素类广谱杀虫剂，每平方米1～1.5毫升，稀释2000～3000倍，全面喷施土表，翻入10～20厘米，也可对水后沟施或穴施。3.35%的威百亩水剂(线克)是一种低毒灭生性杀菌剂。定植前20天左右，土壤温度高于15℃后开沟，每亩用药4～5公斤，对水400～500公斤，喷于沟内，耙平、盖膜，15天后揭膜，翻地透气2～3天后定植。