青枯病是番茄常见的维管束病害，秋季湿度大时在保护地和露地均可发生，沿江地区多雨年份发生严重，常造成植株青枯死亡。
番茄发生青枯病，苗期症状不明显，直至开花后症状才明显。病株叶色变淡，呈萎蔫状，先是上部叶片萎蔫，随后是下部叶片，最后是中部叶片。病初叶片中午萎蔫，早晚能恢复，反复多次后病株青枯死亡。病茎中下部皮层粗糙，常长出不定根和不定芽，病茎维管束变黑褐色，但根部正常。横切病茎放入清水中浸泡或用手挤压切口有乳白色黏液（病菌菌脓）溢出。
番茄青枯病属细菌性病害，由青枯假单胞菌侵染引起。病菌随病残体在田间越冬，通过雨水、灌溉水及农具传播，从根部或茎基部伤口侵入，造成导管堵塞及细胞中毒。病菌喜高温高湿和偏酸性环境，气温30～37℃、土壤含水量超过25%，持续降雨后突然转晴易发病。连作、土壤偏酸性、钙磷缺乏、通风不良、湿度大的田块发病重。
在番茄青枯病发病初期可以喷施农用硫酸链霉素、 霉灵、甲霜灵等药防治，重病株需拔除销毁，并用农用硫酸链霉素灌根。该病发生后防治难度大，重点应采取措施预防，主要措施是种子处理和对土壤或栽培基质消毒。