由于西红柿茎秆可着生不定根，菜农常将较高的西红柿苗卧栽，使其茎秆趴在畦面的斜坡上，然后在茎秆上培土，促发茎秆着生不定根，这样根系发达，吸收营养多了，植株自然就更加粗壮。最近，河北等地不少菜农打来电话反映，拱棚越夏西红柿茎秆培土后，很多植株的茎秆与土壤接触处出现了烂秆子现象。根据菜农描述的发病情况判断，主要是西红柿晚疫病和细菌性软腐病侵染所致。
西红柿晚疫病侵染西红柿茎秆，常在接近地面的茎部发病，病斑呈水浸状，黑褐色，凹陷，致植株萎蔫或折断。细菌性软腐病侵染西红柿茎秆，发病初期造成病茎表皮颜色变深，后病部表皮变粘，有臭味。
这两种病害发病重，主要是田间湿度大所致。尤其是在雨季，雨日多、雨量大、持续时间长是决定这两种病发生和流行的重要条件。所以，菜农朋友应从创造不利于发病的环境条件入手，防治西红柿烂秆子。
首先，培土时土壤湿度不可过大。应在西红柿培土前浇水，划锄并充分晾晒，然后再进行培土。培土后最好不要立即浇水，因此时伤口较多，容易造成病原菌侵染。
其次，严防雨水进棚。随着雨季来临，因雨水进棚导致病害多发的情况时有发生。为防雨水进棚，菜农应及时关注天气预报，下雨前及时关闭放风口，防雨水进棚。一旦雨水进棚，应及时排涝，并喷药防病。
再次，药剂防治。培土前，建议菜农喷洒一次50%甲霜铜可湿性粉剂600倍，重点喷洒茎秆基部，兼防西红柿晚疫病和细菌性软腐病。培土后若发现有发病情况，应及时喷淋72%克露500倍液或金雷800倍液配合有机铜制剂如DT500倍液，防烂秆子。