防治裂果番茄裂果是一种常见的生理性现象，出现裂果的主要原因是水分失调，与品种也有较大关系。预防番茄裂果的措施：一是品种选择。宜选择抗裂、枝叶繁茂、果皮较厚且较韧的品种。二是保持土壤湿润。采用地膜覆盖或厢面稻草覆盖栽培，维持较为稳定的土壤湿度，防止忽干忽湿。三是增施有机肥，改良土壤结构，提高土壤保水保肥能力。四是适度整枝摘心，保证植株枝叶繁茂，加强植株内多余水分的蒸腾，防止强光直射果实。五是大雨前及时采收番茄。六是在果实膨大期，用0.3%－0.4%的波尔多液喷洒植株，对防止番茄裂果有较好的效果。
早疫病：发病后叶面具同心轮纹状病斑，暗褐色，水渍状。茎和叶柄、果实等发病后也有同心轮纹病斑，潮湿时病斑上有黑色霉状物。发病前后可用70％代森锰锌可湿性粉剂500倍稀释液，或75％百菌清可湿性粉剂400倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷3－4次。
叶霉病：果实发病时蒂部周围有凹陷较硬的黑色病斑，叶片有不规则黄色病斑，潮湿时产生褐色霉层，使叶片枯黄、卷曲，然后脱落。设施栽培发病较重。发病前后可用70％代森锰锌可湿性粉剂500倍稀释液，或50％速克灵可湿性粉剂800－1000倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷3－4次。
灰霉病：开花期可在蘸花药液中加入0.1％的50％速克灵可湿性粉剂或50％扑海因可湿性粉剂，效果很好。也可对果实喷雾，但应注意轮换用药，防止病菌产生抗药性。还可用50％多克粉尘剂，每亩喷粉1公斤。
病毒病：发病初期可用20％病毒A可湿性粉剂500倍稀释液，或高锰酸钾1000倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷2－3次。
晚疫病：受害叶柄和主茎呈黑褐色腐烂，幼苗萎蔫倒伏，病斑从叶尖叶缘开始，潮湿时有白色霉状物，干燥时干枯，病斑由暗色转暗褐色，水渍状或云纹状，稍凹陷，病果坚硬。发病时可用40％疫霉灵可湿性粉剂300－400倍稀释液喷雾，每7天1次。也可用粉尘法防治，即用丰收10型喷粉器喷5％百菌清复合粉剂，每次每亩喷1公斤，傍晚喷施。
脐腐病：危害番茄果实。发病时可根外追施1％过磷酸钙、0.1％氯化钙或0.1％硝酸钙等，每10天1次，连喷2-3次。
斑枯病：叶片发病时呈水渍状，病斑近圆形，中央灰白色，边缘暗褐色，稍凹陷，如鱼目状，后散生黑色小点，易穿孔。叶柄、茎和果实都可散生小黑点。发病初期可用70％代森锰锌可湿性粉剂500倍稀释液，或50％多菌灵可湿性粉剂500倍稀释液喷雾，每7天1次，连喷3-4次。
青枯病：一般从坐果期开始发病，中午萎蔫，傍晚恢复正常，2-3天后枯死，横切病茎可流出白色菌液。可用25％DT可湿性粉剂600倍稀释液喷雾，也可用200毫克／升的农用链霉素灌根，每株0.5公斤，7天1次，灌3-4次。
虫害主要有棉铃虫和蚜虫。棉铃虫应在开花期每隔5-7天喷洒Dr杀虫剂、灭铃虫皇等高效、低毒、低残留杀虫剂，并经常更换施用；蚜虫可用抗蚜威、乐果喷雾毒杀。