大棚番茄常见的畸形果有多心室果、空洞果、裂果、脐腐果和日灼果等。形成畸形果的原因，一是苗期氮肥施用过多，地上部生长过旺，冠根比失调；二是花芽分化时，遇到连续低温（6℃至8℃），番茄呼吸作用消耗的养分相对减少，花器中积累的养分增多，心皮数形成较多，易形成多心室畸形果；三是植株老化，当温度低、光照差时，花器与果实不能正常发育，易形成尖顶果；四是棚内温度高，湿度大，光照不足，花粉败育，受精不良，果实中果胶含量少，易形成空洞果；五是营养物质中供钙量不足，易形成开裂果与脐腐果；六是使用激素处理时浓度不当，或植株生长较弱时，也会产生空洞果或酸浆果等；七是摘除老叶过多，易形成日灼果和着色不良果等。
为提高番茄产量，改善果实品质，减少畸形果的形成，应采取如下技术措施：
一、抓好肥水管理番茄生育前期要控制氮肥的施用量，开花坐果期须平衡施用氮、磷、钾肥，增施硼肥和钙肥。在坐果高峰期可喷施0.5％的过磷酸钙溶液或0.7％的氯化钙与0.005％的萘乙酸混合液2至3次，能够有效防止脐腐果和裂果的产生。合理浇水，防止棚内湿度过大或土壤过干。
二、保温增光防冻寒潮来临，要及时加盖草帘或在大棚内搭低弓覆膜保温，防止冻害。当天气晴好时要揭开草帘，尽量增加光照面积，提高光合强度和光合效率，做到勤揭勤盖。
三、科学调控生育番茄株型和生长状况，是可以通过人为控制的。一是当幼苗生长过旺时，可喷75毫克／千克的多效唑溶液来控长。二是合理整枝抹芽、疏花，及时摘除畸形幼果。打顶时应在顶心处保留2片幼叶，起护果作用，防止幼果灼伤。三是合理使用激素保花保果，浓度切忌过高，并做到不重复施用。