西瓜的病害主要有炭疽病、猝倒病、疫病、枯萎病、蔓枯病、病毒病、白粉病。虫害主要有潜叶蝇、种蝇、黄守瓜、蚜虫、红蜘蛛、小地老虎等。以综合性农业措施，减少病虫害的发生。
(1)集中种植，分区轮作。西瓜的轮作周期旱地5年以上，水田3年。
(2)清洁田园，减少病虫源。清除田间和瓜田附近杂草，减少虫源和病源。在生长期间发现病株、病叶，应及时整枝，剪下瓜蔓、病叶，带出瓜田，集中烧毁。
(3)选用抗病品种、健株种子，或进行种子消毒以杜绝因种子带菌而感染病害。
(4)施用腐熟农家肥：牛、羊等畜禽粪、土杂堆肥等应高温发酵后应用，或曝晒后堆制，以减少虫卵和病菌，杜绝肥料带菌而引起发病。
(5)培养无病健苗：采用无病培养土、床土消毒及苗床防病等措施，避免因幼苗带菌而引起病害的发生。
(6)加强田间管理：从开沟排水，铺设地膜，合理施肥，增加磷、钾肥等方面人手，促使植株健壮生长，提高植株抗病能力，在整枝、压蔓及人工授粉时，应防止操作过程
中传播病害。
(7)调节土壤酸碱度：酸性土壤有利于大多数病菌生长。因此，对酸性土壤667平方米施石灰100kg、草木灰1500-2000kg，可以调节酸碱度，起到杀菌作用。
