保护地西瓜病虫害主要有细菌性病害、炭疽病、根结线虫病、蔓枯病、白粉病、温室白粉虱、潜叶蝇等。其发生特点与防治方法如下：
立枯病 主要发生在育苗中期，通过雨水、流水、沾有带菌土壤的农具以及带菌的堆肥传播。病菌生长适温为17～28℃，高温有利于菌丝的生长发育。土壤湿度偏高，光照不足，易发病。防治方法：苗床发现病株要及时拔除，每星期喷1次铜铵合剂（硫酸铜2份，硫酸铵15份，熟石灰4份，混匀后密闭24小时，使用时药粉1份加400倍水）。大田定植后发病植株用70%敌克松原粉稀释成1000～1500倍液灌根。
幼苗猝倒病 苗期发病，幼苗基部呈水渍状病斑，逐渐变为黄褐色，干枯收缩，突然倒伏。低温（10～15℃）高湿、光照不足易引起侵染发病。防治方法：苗期发现少数猝倒病苗应及时将病苗连同周围的病土移到苗床外烧毁，并用70%百菌清、70%敌克松500倍液灌根。
炭疽病 整个生长期都能发病，主要危害幼苗、叶片和果实。靠雨水或灌溉水冲溅传染，近地处蔓叶常先发病。温度在10～30℃时均可发病，湿度越大发病越快，以温度24℃和95%高湿条件下发病最盛。防治方法：发病初期对叶面喷50%多菌灵500～800倍液，或65%代森锌500～700倍液，或70%百菌清500～700倍液，或25%瑞毒霉800倍液。
根结线虫病 近几年来西瓜根结线虫病发病十分普遍。主要以病土、病苗及灌溉水传播。病菌发育适温为25～30℃，10℃以下停止活动。在地势高燥、土壤质地疏松、盐分低的情况下发病重，多年连作的地块发病也重。防治方法：深翻土地，清除病残体等能压低病原基数。高温高湿杀灭法操作简便，效果好，成本低。另外用阿维菌素、辛硫磷乳油或晶体敌百虫稀释液灌根，有一定防治效果。
蔓枯病 经风吹、雨溅传播危害。20～30℃为发育适宜温度。高温多湿，通风透光不良，施肥不足或植株生长弱时，叶片受害重。防治方法：可用75%百菌清可湿性粉剂600倍液，每隔5～7天喷1次，连喷2～3次。还可用70%甲基托布津可湿性粉剂800～1000倍液防治。
白粉病 田间湿度大、温度在16～24℃时发病最重。防治方法：发病初期要摘除病叶，及时喷药，可选用50%甲基托布津可湿性粉剂1000液，或75%百菌清可湿性粉剂500～800倍液，或农抗120水剂200倍液喷雾。一般间隔5～7天喷洒1次，连喷3～4次。
温室白粉虱 繁殖的适温为18～21℃，成虫有趋黄习性。防治方法：消灭温室虫源，通风口设置防虫网，在种植前用22%的敌敌畏烟剂棚内消毒。可用黄板诱杀成虫。也可用10%扑虱灵乳油1000倍液，或25%灭螨猛乳油1000倍液，或2.5%天王星乳油3000倍液喷雾。
潜叶蝇 当幼苗受害时，应立即用80%敌敌畏乳油2000倍液，或用90%敌百虫1000～1500倍液喷雾。
