近年来，各地发生西瓜瓤肉质恶变（瓜农俗称为水串瓤、水红瓤等）情况较为严重，发生病害的西瓜失去食用价值，有不少地块全田发病，甚至绝收，瓜农损失惨重。该病害发病高峰期，大棚西瓜一般发生在五月下旬之后，露地西瓜大都在七八月份。
该病初发时，种子周围的果肉成水溃状，逐渐变成紫红色，后期整个瓜瓤变成紫色，最后溃烂。
西瓜果实发育期的最适宜温度是25～30℃，低于18℃就会出现皮厚、空心或畸形现象，温度达到45摄氏度将会造成果实细胞的原生质凝固。温度过高或阳光曝晒，都会给果实造成不良影响，使果实产生生理病变，光合产物和水分运输等代谢功能受阻，这是西瓜瓤肉质恶变的主要病因。阴天骤晴、干湿剧变、瓜秧瘦弱或发生病毒病的情况下也容易产生肉质恶变瓜。
预防西瓜瓤肉质恶变措施：1、要正确掌握好西瓜大棚内的温度，特别入夏以后棚内温度自然急剧上升，不可再高温闷棚催熟，要根据实际情况加大通风力度，必要的时候实行昼夜通风。2、避免强光对果实的直晒。可用瓜叶或杂草适当遮盖果实。3、前期培育壮苗，预防蚜虫等害虫的危害，防止病毒病的产生，后期要喷施含钙等优质叶面肥补充微量元素，延长叶片功能期。4、进行翻转果实（但不可把西瓜一次翻转180度），使果实受光均匀，也有利于提高果实的品质。5、防止土壤干湿剧变，特别生长后期要均衡供水和适当控制供水。只要措施得力，西瓜瓤的肉质恶变现象并不难避免。
