在侵染烟草的根结线虫中，Meloidogyneincognita、M．javanica、M．arenaria和M．hapla是最重要的几个种。对每个种的生理小种进行了鉴定，结果表明，每个种的抗性育种过程都很复杂。抗Meloidogyneincognita1号和3号生理小种的性能是由TI706衍生来的，用这种抗性育成了第一个抗线虫品种NC95。显然这种抗性是由多基因控制的，然而，与N.sylvestris×N.tomentosiformis的一个异源多倍体杂种进行杂交，却获得了显性单基因控制的抗性。以后的试验结果说明，这个单基因控制的抗性来源于N.tomentosa或N.tomentosiformisG染色体（Slana等，1977；Slana和Stavely，1981）。具有这一抗性的烟株受到PVYMN株系侵染时表现坏死反应（Rufty等，1983），这种现象为筛选分离世代单株是否具有此种抗性基因提供了一个简单而又有效的途径。
关于抗M.javanica的育种，在南非和津巴布韦分别利用抗M.javanica的栽培品种，例如NC95和当地的品种R83（TI1400）或其衍生材料RKT15-1-1培育成抗病品种，其抗性来源于一种不同的部分显性基因（MacKenzie和Ternouth，1986；Cornelissen和VanWyk，1987）。中国烟草在线摘自烟草――生产，化学和技术虽然R83和RKT15-1-1两个品种对M.javanica的抗性水平都较低，但2个亲本的基因重组的后代表现出高水平抗性。南非品系（SAN和NOD）对M.javanica的2号和4号生理小种具有抗性，对其他M属种也有部分抗性。某些烟属的种，包括残波烟草（N.repanda）、长花烟草（N.longiflora）都对M.javanica具有抗性。具有残波烟草和长花烟草二者抗性基因的烤烟育种选系RL在津巴布韦表现出了高水平抗性（Ternouth等，1996）。另外，日本的栽培品种Okinawa也是有希望的抗M.javanica源。耳状烟草的类似材料LaQuinta对M.incognita4号生理小种具有抗性（Reed和Schneider，1992）。这些抗源之间的关系还不清楚，但是低温敏感的抗M.javanica品系和那些抗M.javanica品系的相似性说明，两种抗性是等位的（Rufty等，1983；Kadotani等，1985）。
