一、消毒药物的选择
应根据消毒杀菌的对象，选择一定的消毒药物和消毒方法，详见
二、应用消毒药的注意事项
注意用药安全烧碱、过氧乙酸等酸、碱类消毒药易灼伤皮肤、黏膜，有很强的腐蚀性，消毒时要搞好防护，高浓度情况下不可带猪消毒。消毒后6小时，再用清水冲洗，以防猪蹄和皮肤受到损伤。应用氢氧化钠等碱性消毒剂要注意对棉、毛、纤维织品等的防护。甲醛熏蒸、醋精熏蒸消毒时要注意防火和人身安全。盛过氧乙酸的容器不要密闭太严，以免因过氧乙酸分解产生氧内压而爆炸。
注意用药浓度药液浓度低于有效浓度时，对微生物不能起到预期的杀灭作用，如果浓度过高，则会造成不必要浪费，因为药效达到一定浓度后，其效应则不再增加。消毒药的最适温度为15～20℃，温度较低时，其消毒液应适当加温或加高药物浓度。
注意消毒时间消毒药物与病原接触时间的长短与其消毒效果密切相关。因此，为达到充分消毒的效果，必须根据不同消毒药的要求达到规定的作用时间。
注意药物相互拮抗作用有些消毒药物混合使用，将会降低消毒效果或失去药效，产生毒性。碱性药物不能与其它药物混用，阴离子表面活性剂不能与阳离子表面活性剂混用，使用菌毒灭等复合酚消毒剂时，禁止使用喷过农药的喷雾器喷洒本药，以免意外中毒。因此，消毒药剂尽量要单独使用，方能保证药效。
三、主要疫病的消毒措施
四、消毒方法
机械消毒法如栏圈清扫、洗刷、饲槽的清洗等，可从表面除去大约25％～51％的病原。机械清除工作，一般在消毒前进行，以减少污物的屏障作用，提高消毒效果。另外，通风换气可大大减少空气中的病原。
物理消毒法阳光照射病原微生物，可使病原内蛋白凝固而死亡。高温能使微生物体内蛋白变性、凝固而死亡。蛋白质含水量越高、凝固温度越低，所以湿热比干热消毒效果好。高温的消毒方式主要有煮沸和高压蒸气。要根据不同病原的抵抗力采取一定的高热消毒方法。低温对于微生物只有阻滞繁殖的作用，不能杀灭病原微生物，因此，一般不采用低温消毒法。紫外线对酶类、毒素、抗体等都有灭活作用，可使微生物蛋白变性从而起到杀灭病原体的作用。紫外线对病毒、噬菌体、细菌、真菌、原生动物的作用随紫外线的密度和照射时间可分为刺激、抑制及杀灭三个阶段。紫外线的杀菌强度与照射强度有密切关系。照射距离越近，杀菌能力越强。紫外线仅能杀灭直接照射到的微生物，用于杀灭被有机物保护的病原时，应加大照射强度。
化学消毒法化学消毒剂有气体、液体及固体消毒剂，最常用的是液体消毒剂，影响其消毒效果的主要因素有：消毒药物的选择、药物浓度、温度、酸碱度、接触时间、微生物的类属、特殊构造、生长时期和浓度等。化学消毒剂可分为酸类（如硫酸、盐酸等）、碱类（如氢氧化钠、生石灰等）、酚类（石炭酸、来苏儿等）、醇类（酒精等）、氧化剂（漂白粉、高锰酸钾等），甲醛和其它消毒药（如新洁尔灭）。
生物学消毒法粪便和土壤中有大量嗜热菌、噬菌体，土壤中还有一些抗生物质。这些嗜热菌、噬菌体及抗生物质对于杀灭病原微生物都有一定作用。生物学消毒是粪便最好的消毒法，因为此法处理后的粪便，并不失去肥料的价值，由非芽胞微生物所引起的大多数病原，都可应用此法消毒。
