㈠防制措施
由于患猪大量排毒，且病毒对外界环境有很强的抵抗力。猪一旦被感染，消灭本病是困难的。本病的防制主要是加强兽医防疫工作，限制猪与猪直接接触，减少应激，以及预防并发或继发感染。
⒈加强饲养管理
⑴引进种猪时，要注意来源猪场必须是实施严格的生物安全措施，并且猪群中必须没有PMWS的临床症状。引进种猪做好隔离检测和风土同化等工作。
⑵加强外部生物安全措施，包括严格控制来访者及外来车辆、外来货物等。
⑶产房、保育舍、生长育成舍应做到全进全出。
⑷限制交叉寄养，如确需，应在24小时内进行。
⑸降低饲养密度。必要时可出售部分保育舍仔猪和生长猪。
⑹不要将不同来源的猪或不同日龄的猪混群饲养。
⑺将病弱仔猪及时淘汰或隔离治疗。
⑻减少应激。如减少或暂停保育阶段的免疫接种。
⑼改善空气品质。
⑽分娩舍、保育舍温度的控制和调整（大环境、通风、透气。小环境，保温）。
⑾栏圈小，壁式分离。
⑿加强消毒工作。分娩舍、保育舍空栏消毒三次（隔天一次），其中一次薰蒸消毒。因猪圆环病毒2型对大多消毒剂不敏感，故选择广谱有效的消毒剂特别重要。
⒉免疫接种
⑴猪圆环病毒2型疫苗的免疫接种
①猪圆环病毒2型的母源抗体可以从母猪传给仔猪，有效预防仔猪不发生猪断奶后多系统衰竭综合征。如果仔猪没有得到足够的被动免疫抗体，仔猪感染猪圆环病毒2型并引起免疫系统调节障碍，是引发疾病的关键。
现美国和西欧以及我国的一些科研单位和高等院校正在研究猪圆环病毒2型疫苗，但仍未应用于生产。
②感染物质的免疫
用本场保育仔猪的粪便、死仔、弱仔、病仔猪等病料，感染后备种猪和产前一个月（有抗体存在）的妊娠母猪，提高猪圆环病毒2型母源抗体水平（但有学者认为有危险性）。
③自家灭活疫苗。用本场病料制成灭活疫苗进行免疫，有一定效果。
⑵共同感染源的免疫接种
①已知共同感染源的免疫
②其他可能共同感染源的免疫接种
不同猪场的疾病谱是不完全相同的，要确定自身的可能共同感染源，实施合理的免疫程序至关重要。
⒊药物防治
药物特别是抗生素只是控制细菌继发感染，对病毒的结果不确切。而且不同的猪场混合／继发感染的细菌不完全一样，单纯使用一种抗生素不能完全覆盖所有要控制的细菌，必须采用药物组合的方法，既控制支原体，又要控制链球菌、巴氏杆菌、胸膜肺炎放线杆菌等。
策略性用药
母猪：产前、产后一周，饲料添加药物，可减少喘气病等病的影响，如泰农1250ppm+金霉素300ppm。
仔猪：预防特异性细菌感染，如链球菌、副嗜血杆菌等。于仔猪断奶后14天，饲料添加药物，如支原净110ppm+金霉素300ppm+阿莫西林200ppm。
抗菌及退热药可同时使用。
发热是猪断奶后多系统衰竭综合征经常出现的早期症状。据报道，使用30毫克/公斤（1000ppmm饲料中）醋氨酚，断奶后连续使用14天，对猪断奶后多系统衰竭综合征猪群明显降低发病率。
⒋血清学
采用来自痊愈期和健康肉猪或母猪血清，以56℃热处理1小时，加入抗生素，于仔猪断奶前腹腔注射5～10毫升，可降低死亡率和减轻症状。在管理措施不易提高的猪场，血清疗法在防制猪断奶后多系统衰竭综合征中起重要作用。实行此法的猪只，仅能用本场的供血猪。
