由于母猪在养猪生产中的特殊地位，从某种意义上说，母猪客观上成为猪场疫病的“传染源”。因此，严格做好母猪的防疫管理，对于控制全场的疫病控制非常重要。
⒈隔离
对于新引进的种猪必须在观察猪舍隔离，经过45天饲养，做完有关预防注射，并用本场母猪粪便饲喂，让其自然感染，确认健康、稳定后才能进入猪舍。
⒉建立生物安全制度
包括自繁自养制度、饲料安全卫生制度、入场的消毒更衣制度、人员管理制度、饮水的卫生检查制度、装猪台清洁与消毒制度、病死猪的无害化处理制度，粪污水处理管理制度等。
⒊坚持严格的卫生消毒工作
母猪舍应坚持每周两次带猪消毒，尤其是对空怀母猪和临产母猪，消毒药应交替使用。空栏以后要彻底清洗、消毒、干燥。消毒剂一般选择高效、环保、广谱消毒药物。如碘－季胺的复合制剂，含氯、含碘消毒剂、复合醛等。消毒时采用喷雾、喷洒方式。
⒋制定科学合理的免疫程序
各猪场应根据本场情况订出适合本场的免疫程序。
注意事项：
⒈卫生消毒管理欠佳的场，可对1、2胎母猪产前注射大肠杆菌基因苗、红痢菌苗、猪传染性胃肠炎苗或猪流行性腹泻、轮状病毒疫苗。另外，也可选用猪肺疫、猪丹毒、猪链球菌病、猪传染性胸膜肺炎等疫苗注射。规模化猪场以使用各疫病的单苗为宜。
⒉种猪场应做好免疫检测，即在猪群注射免疫后10～14天，抽样采血分离血清送检，检测抗体消长情况，并检疫某些传染病，制定当时免疫程序和疫病净化。
⒊种猪场血清学检测若无伪狂犬病、蓝耳病，尽量不用疫苗。尤其是蓝耳病，不要给妊娠母猪和育龄公猪使用。若是疫区污染不严重，选用基因缺失灭活苗为宜，注意尽量选用固定厂家基因缺失苗，防止多厂家基因缺失苗混用，以免病毒基因发生重组现象。在暴发猪瘟、伪狂犬病或细小病毒时，应尽早使用弱毒苗进行全群紧急接种。但在疫情稳定后或老疫区为了净化疫病则要用灭活苗。
