法氏囊是鸡体内重要的中枢免疫器官，一旦受损，会产生暂时或永久的免疫抑制，影响鸡的免疫应答、抗病毒能力和生长速度，也极易诱发疾病的发生。法氏囊有病变时，不一定是法氏囊病，其他如细菌性病、病毒性疾病、中毒和应激等也有该器官的变化。
一、鸡传染性法氏囊病
法氏囊水肿呈球状，出血呈葡萄状，法氏囊外有胶冻样渗出液，囊内分泌物增多，或有奶油状渗出，随患病时间延长，囊色呈黄粉色、奶酪色、灰黄、灰白变化并逐渐萎缩，萎缩程度比其它疾病重。
二、鸡新城疫
法氏囊有出血、坏死或干酪样物，但未有法氏囊病的黄色胶冻样水肿和蜡黄色萎缩，腺胃及盲肠扁桃体肿胀出血，有呼吸道和神经症状。
三、鸡肾型传染性支气管炎
病鸡多见肾脏肿大和尿酸盐沉积，法氏囊充血、潮红，内有粘性分泌物，患鸡有明显的呼吸道症状，气管充血、水肿，支气管上端有粘液栓塞。
四、包涵体肝炎
病鸡法氏囊萎缩，呈灰白色，肝脏脂肪变化，坏死，有大小不等的出血点、脾脏肿，骨髓呈桃红色。
五、禽肾炎
本病多散发，与病毒感染有关，死于本病的鸡常有急性肾炎表现，法氏囊萎缩，呈灰色，但萎缩程度比法氏囊病轻。
六、鸡大肠杆菌病及败血性病
法氏囊潮红或灰黄色，囊壁薄，内有分泌物，患鸡有心包炎、肝周炎、腹膜炎、气囊炎等病变。
七、磺胺药中毒
各种磺胺药物连续5日用量超过0.5%时，可引发中毒，法氏囊呈灰黄色，无水肿，内脏器官、皮下组织、肌肉出血，鸡兴奋、腹泻等。
八、预防措施
第一，可通过疫苗接种，药物预防，加强管理；第二，投服有增强免疫和清热解毒作用的中药；第三，法氏囊有损伤时，及时查出原因，对症、对因治疗，并投喂黄芪、大青叶、石膏、板兰根及清热解毒的药物。
