1.与鸭瘟鉴别
鸭瘟是由鸭瘟病毒引起鸭的一种高死亡率的急性传染病，虽然各种日龄的鸭均可感染发病，但3周龄以内的雏鸭较少发生死亡，而病毒性鸭肝炎对1～2周龄易感雏鸭有极高的发病率和致死率，超过3周龄雏鸭不发病，这在流行病学上是重要鉴别之一；患鸭瘟的鸭以食道、泄殖腔和眼睑黏膜呈出血性溃疡和假膜为主要特征性病变，与患鸭病毒性肝炎完全不同，可作为重要鉴别之二；用抗鸭瘟病毒高免血清和抗鸭病毒性肝炎高免血清，在1～7日龄易感雏鸭中作交叉中和试验，或交叉保护试验，可作为重要鉴别之三。必要时用鸭胚和鸡胚作病毒分离检验。
2.与鸭巴氏杆菌病鉴别
鸭巴氏杆菌病由多杀性巴氏杆菌引起的急性败血性传染病，发病率和死亡率很高。青年鸭、成年鸭比雏鸭更易感，尤其是3周龄以内的雏鸭很少发生，这在流行病学上是重要鉴别之一；患鸭巴氏杆菌病的鸭肝脏肿大，有灰白色针尖大的坏死灶和心冠脂肪组织有出血斑，心包积液，十二指肠黏膜严重出血等特征性病变，与鸭病毒性肝炎完全不同，可作为重要鉴别之二；患鸭巴氏杆菌病的鸭肝脏触片，心包液涂片，革兰氏或美蓝染色见有许多两极染色的卵圆形小杆菌，用肝脏和心包液接种鲜血培养基能分离到巴氏杆菌，而鸭病毒性肝炎均为阴性，可作为重要鉴别之三。
