（一）选留程序不合理，选留过程简化：在某些猪场后备猪的选留过程非常简单，没有固定的程序，只是在种猪结测完后，简单评定即可选留，这样做容易造成各血缘选留量不平衡，种猪生产性能下降。所以后备猪选留要有固定的程序作为依靠，一般后备猪的选留要经过初选、中选和定选三个过程，初选是由产仔段转向育成段时，确定留种量4倍的待选群；中选是指仔培向育肥转群时，从待选群中选留50%的个体留做待选后备群；定选是指在结测完后，按照测定结果选择优秀个体确定后备猪群。每个阶段都有不同的选择标准，初选主要是根据祖先的测定成绩，以及个体本身能够表现的一些性状，如个体重大于1.2kg、乳头数在7对以上且排列整齐，无瞎乳头、内陷乳头等，全同胞都无遗传疾患；中选主要是看生长速度和体型外貌特征；定选标准是综合以上的测定数据结合结测结果，对种猪进行综合指数计算，30～100kg的日增重、背膘厚度在平均水平的120％以上，父系指数和母系指数要在100％以上，只有严格按照一定的选留程序进行后备选留，才能避免选留的盲目性，从而提高整个群体的生产水平。
（二）过于依赖性能测定成绩，忽略了体型外貌的选择。在后备选留过程中性能测定成绩固然重要，但是体型外貌的评定也不可 忽视，只有体质结实，结构紧凑才能维持其正常的生殖功能，并且某些体型性状与生产性能还存在着很强的相关性，例如有报道讲前肢系部的弯曲度与生长速度的相关性为0.44，如选择前肢系部发育正常的个体，其生长速度也会很快提高。体型结构紧凑、体质结实的个体，利用年限也会延长，Grindflok等观察运动性能差的母猪，第四胎在群的比例均低于21％，所以在选留后备个体时一定要注意该个体四肢发育情况，观察运动的协调性，评定体质结构的紧凑性；此外乳头数也是一个重要的体型性状，在后备选留过程中要保证后备母猪有效乳头数在7对以上，乳头的间距均匀，不得有瞎乳头、内陷乳头、火山乳头。
