首先要确诊，然后才能用药。用药前要核对名称、含量、产地、批号、有效期、外观状态等，只有在核对无误时方可应用。药物在疾病的防治过程中往往出现作用以外的不良反应，如：对肝、肾的刺激，慢性蓄积中毒等。有的药物在体内排泄慢，蓄积作用较强，如果应用不好，往往发生急性或慢性中毒。
注意抗药性。有些菌株随着长期的药物作用，会产生一定的抗药性，造成疗效不佳。在有条件的情况下，可通过药敏实验选择最适合的感药物。按疗程用药，肉仔鸡一般3～5天为一个疗程。各类药物可采取阶段性交替用药，以减少抗药性的产生。药物治病的原则是：对症、早用、合理、彻底。