菜籽饼是一种较好的蛋白质饲料，但菜籽饼含有硫代葡萄糖苷，在鸡体内会产生有毒物质，而且味道辛辣，适口性不佳，故在使用时应注意下面几个问题：
喂量要适当：在鸡的日粮中，搭配菜籽饼的比例不宜过高。一般来说，生长鸡用量可占精料的5%-10%，占干物质量5%-8%，这样不经去毒也可和其他饲料搭配使用。当然，油菜的品种不同，含有的硫代葡萄糖甙量差异很大，实际喂量应根据当地的油菜品种、榨油工艺和土壤含硫量而酌情增减。
进行必要的去毒处理为了安全利用菜籽饼，尤其是在鸡日粮中菜籽饼搭配量超过10%时，应该进行必要的去毒处理。常用方法：坑埋法。此法应避开梅雨和高温季节。选择地势高燥、土质较好的地方(不可在树下)，挖一宽0.8米，深0.8米，长度按菜籽饼数量确定的长方形坑，内铺3厘米厚的麦草，将粉碎成末的菜籽饼以1∶1的比例加水拌湿埋入坑内，上铺一薄层麦草，再覆土40厘米厚。四周开排水沟，以防雨水渗入。两个月后，即可开坑利用。注意四周发霉结块的部分不宜作饲料。采用此法无需其他设备，去毒率在90%以上。蒸煮法。一般小规模少量饲喂时，可将粉碎的菜籽饼用温水浸泡8-12小时，将水倒去，再加清水煮沸1小时，并时时搅拌，即可使毒物蒸发。
增喂青绿饲料：增喂青饲料可改善整个饲料的适口性和减轻菜籽饼的毒害作用，但不宜喂富含芥子酶的十字花科植物，如白菜、萝卜、甘蓝等。
防止中毒：禁用霉变菜籽饼喂鸡，在配料时应充分搅拌均匀，以免有些鸡误食菜籽饼过多，引起中毒。