秋冬季节是山羊抓膘育肥的关键时期，同时也是各类疾病的多发季节。在秋冬季节，山羊常见的疾病主要有快疫类疾病(羊快疫、羊猝狙、羊黑疫、羊肠毒血症)、传染性胸膜肺炎、乳房炎、寄生虫病等。养殖户一定要加强管理，做好秋冬季节山羊疾病的预防和治疗。
羊快疫。该病发病突然，几乎没有治疗时间，以免疫预防为主，常用疫苗是“羊快疫—羊猝狙—羊肠毒血症”三联苗或“羊快疫—羊猝狙—羊肠毒血症—羔羊痢疾—羊黑疫”五联苗。皮下注射5毫升，注射两周后产生免疫力，保护期半年以上。
羊肠毒血症、羊猝狙、羊黑疫。这些疾病发病迅速，往往来不及治疗即死亡。对少数经过缓慢的病羊，及早使用抗生素、磺胺类药物和肠道消毒剂，并给予强心、输液、解毒等治疗，有治愈的希望。最好的办法是，提前使用三联苗或五联苗
接种预防。
山羊传染性胸膜肺炎。该病可通过接种山羊传染性胸膜肺炎氢氧化铝菌苗预防，6个月以下的山羊注射3毫升，6个月以上的山羊注射5毫升，注射后14天可产生免疫力，免疫保护期为1年。对病羊可使用土霉素、四环素、氯霉素等进行治疗，连用5-7天，可取得一定疗效。
乳房炎。母羊得了乳房炎，应清洗乳房并处理外伤，对发热的乳房冷敷，及时挤出乳房中变质的乳汁。药物治疗可用糖盐水、安乃近、四环素静脉注射，注意补充碳酸氢钠以解除酸中毒症状。
绦虫病。可使用20%的生石灰水或5%的克辽林溶液喷洒洗刷羊舍、饲具。预防性驱虫可使用吡喹酮或硫双二氯酚，前者用量为12毫克/公斤体重，后者用量为60-80毫克/公斤体重。药物治疗方法有：口服1%的硫酸铜，1-6个月的羔羊用15-45毫升，7个月以上的羊用45-100毫升。