环境调控：首先要降湿，西葫芦烂花在低温潮湿的棚室环境中易发生，因此环境调控要以保温、降湿为主。由于西葫芦结瓜期的适宜温度为22-25℃，建议菜农在棚温上升到25℃后再放风排湿。其次，浇水要避免阴雨天及降温天气，并注意浇水后第二天提温排湿。另外，及时清除西葫芦的烂花、烂瓜和病叶，防病原孢子继续传染为害。发现烂花、病瓜先套以塑膜袋，然后小心摘除带出棚外深埋或烧毁。
药剂防治：防治灰霉病、菌核病，采取“喷、熏”两结合的药剂防治方法：喷，即叶面喷扑海因或农利灵1000倍液；熏，即闭棚后，在焚烧过的余热未尽的玉米芯上撒上菌核净，然后移入棚内熏棚，亩用量200克。熏棚后要在第二天早通风，放出残留的烟雾。笄霉褐腐病属三孢笄霉侵染所致。于开花期或幼瓜期发病前喷洒72%锰锌·霜脲(克露)700倍液或60%氟吗·锰锌(灭克)800倍液防治效果较好。对于细菌性软腐病，可喷洒有机铜制剂如琥胶肥酸铜500倍液或植物抗生素类药剂如新植霉素2000倍液进行防治。