韭菜迟眼蕈蚊幼虫俗称“韭蛆”，是危害韭菜的重要害虫，近年来在大中棚韭菜田发生严重，轻者造成韭菜黄叶倒伏，重者缺苗断垄，甚至毁种。
迟眼蕈蚊以幼虫危害韭菜地下鳞茎和假茎基部，除危害韭菜外，还危害葱、蒜、莴苣、芋及十字花科蔬菜等。初孵幼虫危害韭菜叶鞘基部和鳞茎上端，春秋两季主要危害韭菜幼茎引起腐烂，造成叶片枯黄、植株枯死；夏季幼虫向下活动蛀入鳞茎，严重时造成鳞茎腐烂，整株死亡。
韭菜迟眼蕈蚊在东台地区露地一年发生6代，世代重叠严重，以幼虫在韭菜鳞茎内或韭根周围3～4厘米表土层中休眠越冬，温室大棚无越冬现象，可持续繁殖危害。卵产在植株周围的土缝内或土块下，大多成堆，次年3月上旬开始化蛹，持续到4月底；幼虫孵化后分散危害。3月中旬至5月上旬为越冬代成虫发生期，以5—7月危害严重。成虫喜阴湿、弱光环境，上午9—11时飞翔最活跃，环境高湿、土壤过湿或过干不利于其发生。
防治韭菜迟眼蕈蚊，应采取综合措施。（1）农业防治。选用无虫韭菜苗移栽，早春韭菜萌芽前扒开韭根表土翻晒，可晒死部分幼虫。早春或秋季幼虫发生时连续灌水3天，每天早晚各一次，淹没垄背，可减轻危害。（2）化学防治。移栽前用48％毒死蜱乳油1500倍液浸泡韭菜根，消灭虫源。幼虫期，当韭菜叶片开始发黄变软时，每亩用48％毒死蜱乳油150～200毫升加水500～1000公斤灌根；成虫羽化期，用20%氰戊菊酯乳油3000倍液于上午9—10时喷洒，每隔10天一次，连续防治3～4次，消灭羽化成虫。