造成大葱根腐烂的关键因素是重茬，由于连续多年种植，土壤中病原菌增多，极易造成大葱根腐死棵。解决措施：实行轮茬种植，一般三年轮作一次。另外还有其他三种病害造成烂根的可能性，具体可以看下面的介绍。
一是根部有根蛆为害。解决措施：定植前先将葱苗严格分级，然后进行药剂处理，以消灭根蛆，保证全苗。药剂选用针对性杀菌剂和新高脂膜混合液。二是除草剂药害。解决措施：喷施除草剂时加入新高脂膜，新高脂膜可改造高毒农药为中毒，中毒农药为低毒，低毒农药为微毒，降低每亩用药量，提高防治效果。
三是积水沤根。大葱叶片水分蒸腾少，根系吸水能力弱，耗水分较少，喜湿怕涝。在生长期间若大水漫灌，容易使大葱田间积涝成灾，发生沤根，干尖，黄叶，死苗现象。解决措施：禁止大水漫灌，要小水勤浇，浇水时结合根施通，促进根系发育，增强根系吸收养份、水份能力。提高吸收水肥的能力。