油菜缺硼时，其根、茎、叶、花、蕾、果都不能正常生长发育，特别是角果会因花器退化而出现“阴角”，形成花而不实，导致菜籽产量明显降低。油菜缺硼各个生育期都能表现症状，以幼苗期、蕾薹期、开花期最为明显。
苗期根系发育不良，生长慢，须根少；根尖端生有小型瘤状物；根颈膨大，严重的表皮变褐色，皮层龟裂甚至坏死，易死苗。油菜移栽后现青迟缓，不长新叶，叶片畸型，小而肥厚，叶缘倒卷皱缩，叶脉褪绿转黄，叶色暗绿无光泽，叶边缘至整个叶片变紫或紫红色。
蕾薹期根茎膨大，根部出现空心，根表皮黄褐色。叶片肥厚而脆弱，叶边缘倒卷，叶面隆起，凹凸不平，叶片褪绿变成蓝色紫斑。薹茎发育不正常，薹短薹细，植株矮化，甚至枯萎死亡。
开花期根部和叶片症状同前。主花序生长缓慢、矮化，顶端萎缩。开花偏迟，无明显终花期。花器退化，花粉发育不正常，形成花而不实，不能正常形成角果。