为有效防控重大动物疫病，确保动物产品质量安全，奶牛养殖场户应对病死的奶牛进行无害化处理，无害化处理的方法很多：如掩埋、焚烧、化制、发酵等。因奶牛个体较大，深埋是对奶牛尸体进行无害化处理最简单最有效的办法。“掩埋法”的具体操作如下：
一、选择地点
深埋应选择高岗地带，应远离居民区、水源、泄洪区、草原及交通要道，避开岩石地区，位于主导风向的下风向、不影响农业生产，避开公共视野。
二、挖坑
坑的大小取决于所需掩埋奶牛的大小，一般奶牛尸体要求：坑长2.5米、宽1.5米、深2米。
三、掩埋
1、坑底处理：坑底撒上生石灰，每平方米在0.5至2公斤左右，量可以根据尸体的大小在这个基础上进行适量的增减。
2、尸体处理：尸体应该先用10%的漂白粉上清液喷雾，作用2小时。
3、入坑：将其处理过的动物尸体投入坑内，使之侧卧（最好采用柴油对奶牛尸体进行焚烧），并将污染的土层和运送尸体有关污染物如垫草、绳索、饲料、少量的奶和其他物品等一并入坑。
4、掩埋：先用40厘米的土层覆盖尸体，然后再放入约2至5厘米厚的石灰粉，然后掩埋，平整地面，掩埋覆土不要太实，以免腐败产气造成气泡冒出和液体渗漏。
5、场地检查：确认是否有尸体及污染物暴露在地面外。
四、注意事项
1、切忌直接将石灰覆盖在尸体上，因为在潮湿的条件下熟石灰会减缓或阻止尸体分解。
2、掩埋坑底应高出地下水位1.5米以上，要防渗、防漏。覆土厚度不少于1-1.2米。
3、掩埋后，在掩埋处设置警示标识。
4、掩埋后，第一周内应每日巡查1次，第二周起应每周巡查1次，连续巡查3个月，掩埋坑塌陷处应及时加盖覆土。
5、掩埋后，立即用氯制剂、漂白粉或生石灰等消毒药对掩埋场所进行1次彻底消毒。第一周内应每日消毒1次，第二周起应每周消毒1次，连续消毒三周以上。运送尸体的车辆及掩埋人员要进行及时的消毒，以免疾病传播。