由于种肥施用不当，很容易引起玉米烧芽或烧苗，因此，应注意以下几点：
选好施肥品种，控制施肥量尿素等尿基型化肥不宜做种肥，否则容易烧苗，可施用氮、磷、钾复合肥。玉米苗期需肥量较少，为减少浪费，种肥施用量不宜过大，一般每亩用量10公斤左右，特别是趁墒播种时，更要严格控制种肥施用量。
搞好种肥隔离施用种肥时，为避免种子和肥料直接接触导致烧苗，机械播种时要将种子与肥料隔离7～10厘米；人工播种时，要变种下施肥为侧深施或种间穴深施。
保证土壤墒情施用种肥的地块，应足墒下种或播后浇蒙头水，以起到“稀释”种肥的作用，可在一定程度上减轻大量种肥造成的烧苗现象。