1、选用抗病、耐病品种：根据当地实际情况，选用抗病性较好的品种，同时应注意小麦品种的合理布局，避免单一抗源品种的大面积种植。
2、合理施肥增施有机肥，采用配方施肥技术，合理施用氮、磷、钾肥。不要偏施、过施氮肥，控制小麦过分旺长，促进其根系发育，增强小麦抗病能力。
3、合理密植、适期播种该措施是防治纹枯病的有效措施之一。合理播种量，培创丰产抗病的小麦群体结构，防止田间郁蔽，避免倒伏，可明显减轻病害。播种越早，土壤温度越高，发病越重。应因地制宜地确定适宜的播种期，减少病菌侵染。
4、小麦返青后，早浇、轻浇返青水，不要大小漫灌，以避免植株间长期湿度过大。及时清除田间杂草，雨后及时排水，这对控制病害有很好效果。
5、化学防治：
（1）播前药剂拌种。用种子重量0.2%的33%纹霉净可湿性粉或种子重量的0.3%的15%三唑酮（粉锈宁）可湿性粉剂拌种。
（2）春季小麦拔节期，每亩用粉锈宁可湿性粉剂40g，隔10～15d再喷药1次。