小麦苗期受自然条件、栽培措施及耕作方式的影响，经常会出现一些生理性病害，病苗叶色会呈黄白色、褐色、黄色、红色等不正常的颜色，只要及早采取措施，仍能使其转化为正常麦苗。
黄白叶苗主要是缺锌所致。麦苗缺锌导致小叶病发生，叶缘扭曲或皱缩，叶脉两侧由绿变黄直至发白，边缘出现黄、白、绿相间的条纹带。可每亩用硫酸锌1公斤拌细土，在雨后田间湿度大时均匀撒施，或叶面喷施0.1%～0.2%硫酸锌液。
褐叶苗主要是缺钾所致。缺钾的麦苗生长缓慢，根系发育差、易腐烂，叶片呈深绿色或蓝绿色，且软弱下披，叶尖及边缘枯黄，随后变褐，形成褐叶苗。可叶面喷施0.2%～0.3%磷酸二氢钾液，或每亩均匀撒施草木灰120公斤。
黄叶苗（1）缺氮。幼苗细弱呈直立状，叶片窄短，基部叶片从叶尖开始逐渐变黄干枯，并向上部叶片发展。可每亩用尿素8～10公斤或人粪尿400～500公斤，穴施或加水泼浇。（2）土壤干旱。麦苗分蘖出生缓慢，叶色灰绿，心叶短小，生长受阻，中下部叶片逐渐变黄干枯，根少而细。应结合补水，每亩追施碳铵20公斤。（3）土壤板、薄田块。麦苗根系伸展困难，致使麦叶黄短，分蘖不能按时出现。应及时补水，然后破除地表僵硬层。（4）播种量过大，麦苗生长拥挤，植株黄瘦。应着重抓紧理墒压苗或疏苗，再结合补水，每亩追施高效BB肥15公斤。
红叶苗（1）渍害。秋季苗期雨水过多或麦田低洼，会使麦苗叶片变为暗红色，严重时造成烂根死苗。应及时疏通沟系，排水降渍，并追施少量速效氮肥，促苗早发。（2）缺磷。麦苗缺磷，根系发育差，次生根少而弱，叶色暗绿无光泽，叶尖及叶鞘呈紫红色，植株瘦小，分蘖数减少。可每亩补施过磷酸钙25公斤。（3）受冻。应及时理墒壅土或施灰杂肥，覆盖增温保苗。