草鱼出血病与肠炎病
共同症状患病鱼体色发黑，游动缓慢，对外界的刺激反应迟钝，食欲减退，以致完全不吃食。剖开腹部，可见肠壁充血发炎，肠腔内无食物。
区别活检时患出血病的鱼肠壁弹性较好，肠腔内黏液较少，而患肠炎病的鱼肠壁弹性较差，肠腔内黏液较多，严重时腹腔内充满大量的淡黄色液体。
中华蚤病与细菌性烂腮病
共同症状患病鱼鳃上黏液增多，鳃丝肿胀，鳃的某些部位会呈现灰白色或有小出血点。
区别活检时如发现病鱼鳃上有如蛆一样的虫体可诊断为中华蚤病；若肉眼观察不能确定，可通过镜检，镜检时如鳃上有寄生虫寄生即可诊断为中华蚤病，反之则为细菌性烂鳃病。
卵甲藻病与小瓜虫病
共同症状患病鱼体色发黑、消瘦、游动异常，病情严重时全身都布满小白点。
区别活检时仔细观察，患卵甲藻病的鱼体表白点之间有红色充血斑点，而患小瓜虫病则没有；或将小白点处剪下，放在盛水的白磁盘中，用细针将白点的膜挑破，如看到有小虫滚出并在水中游动，即可诊断为小瓜虫病。
白头白嘴病与车轮虫病
共同症状患病鱼自吻端至眼球处的一段皮肤色素消退，变成乳白色，黏液增多，唇似肿胀，呼吸困难，于水面观察病鱼呈现“白头白嘴”症状。
区别诊断时用显微镜检查患处黏液，如发现有大量车轮虫寄生即为车轮虫病，反之则为白头白嘴病。