东北各地多采用地沟冻藏，地沟分活沟和死沟两种。一般在风障、温室或立壕北侧的遮阳处挖一个宽、深各30匣米或宽70～100厘米，深30～70厘米的活沟。在活沟底顺为长方向挖1～3条宽深各20～25厘米的通风道，通风道两侧穿过窖沟的两端到地面上，通风道上面可稀蔬横放些单层秫秸，把香菜放在上面贮藏。

供冬藏的香菜，播种期应比直接上市的晚几天，收获期也应晚些，一般在早晚地面结冻，中午融冻时收获为宜。采收的香菜去掉泥土，摘去黄叶，1～1.5公斤捆成把或撒放在沟内，根向下，叶面撤一层沙土或沟面上盖一层秫秸，以后随气温下降，分2～3次加覆盖物，覆土总厚度为20～25厘米。严寒的季节可再在上面加盖草苫，沟内温度维持在-5～－4℃，使香菜叶片冻结，根部不冻为宜，此法可贮到翌年2月底、香菜出窖后要缓慢解冻．不能急躁。