畸形菇与品种、配方、发菌温度和发菌时间有关。

预防措施。一是选择头潮菇畸形菇率低的香菇品种，防止畸形菇发生。二是栽培香菇时，可大量使用阔叶杂木屑，少量添加玉米芯粉和玉米粉。三是菌棒发菌时注意控制温度，发菌温度不低于20℃，早熟品种发菌75—95天，中熟品种发菌100—115天，晚熟品种发菌120天；如果发菌温度低，要延长发菌时间。

处理方法。首先，发现香菇菌棒产出畸形菇，无论大小要马上采下，促进下潮早出菇。其次，停止喷水，抑制出菇。最后，控制菇棚内温度恒定，缩小温差，抑制香菇子实体原基发生，让香菇菌棒继续恒温发菌，待菌棒达到发菌温度和发菌时间后再出菇就不会畸形。