苏铁茎腐病系由半知菌亚门的球色单隔孢菌侵染而诱发的真菌性病害。病菌以菌丝体于病残叶内越冬，于翌年条件适宜时产生孢子，从叶基部伤口、虫口处侵入，一年四季均可发生，以雨季为重，高温、高湿、易受雨水冲刷、积水及近路边的植株易感病。病变多从近地面开始，先是病部输导组织变为褐色，周围组织变为粉褐色水渍状，组织疏松如海绵状，随后地上部有1～2片羽叶从叶柄基部开始萎缩，维管束变褐色，幼嫩羽叶开始萎蔫。随着病情发展，常见老羽叶叶柄基部干缩倒伏，病部周围变褐腐烂，直至整个茎干腐烂。苏铁茎腐病具有病情发展快、传播蔓延迅速的特点。若未及时发现控制，就会引起大面积发病，造成重大损失。

防治茎腐病除栽植时要做好土壤消毒工作外，平时应注意做好开沟排水，梅雨季节前对未发病的植株可用灭病威100倍液浇灌根茎部预防。若发现病株，则应在发病初期及时切除病部，并用0.2％高锰酸钾液清洗创面，晾干后再用百菌清或多菌灵粉剂涂抹创面防治。亦有报道说，在植株基部周围撒施生石灰，可在一定程度上预防茎腐病的发生。