金针菇褐腐病是细菌性病害，病原菌是一种欧文氏杆菌。属肠杆菌科、欧文氏杆菌属。金针菇子实体被感染后，菌盖、菌柄上都能形成褐色斑点，然后腐烂。这种病菌还能溶解金针菇的菌丝，危害极大。通风不良，温度过高，容易发生。
防治措施：增加菇棚遮阳物，降低温度，发现病菇及时摘除。在病区喷洒500倍链霉素水溶液。
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