在食用菌栽培过程中，感染代料栽培的小型真菌如：木霉属、青霉属、曲霉属、粘菌类等。在条件适宜生长繁殖的环境下，同样可以感染段木。这些小型真菌的形态特征，发生规律在平菇和蘑菇中作了介绍，因栽培形式的不同，防治的方法也略有不同：在菇木的任何部位发现小型真菌感染，可用煤油喷灯对准病菌将其烧死，然后在感染部位再涂刷一层5％一10％的石灰水或煤油、柴油，这样，可有效地防治小型真菌的再感染。