棉花苗期病害有十余种，其中能引起烂种、烂芽、茎基腐和根腐的主要有立枯病、炭疽病、红腐病；其次为猝倒病和根腐病等。以危害子叶、真叶及茎部为主的有茎枯病、疫病、黑斑病、轮斑病及角斑病等。对生产影响最大的是前一类，因它们能造成早期大量死苗，引起缺苗断垄，对产量影响很大。