土壤缺钙时，适量冲施硝酸钙，可补充土壤钙质，同时提升土壤速效氮含量。但蔬菜种植过程中，基肥所用有机肥、生物有机肥中的有机氮，以及复混肥中的氮素用量通常较为充足，菜农额外集中冲施硝酸钙时，需重点防范氮素过量及氮素流失问题。若大棚土壤水解氮含量高于300毫克/千克，不宜大量冲施硝酸钙。
硝酸钙用作基肥时，若田间施用了未腐熟的有机肥，有机肥腐熟过程中，其发酵生成的有机酸会与硝酸钙发生反应，造成氮素以气体形式挥发损失。同时，硝态氮水溶性强，蔬菜定植后田间浇水频次较高，易将土壤中的硝态氮淋洗至耕层以下，甚至渗入地下水，导致养分流失。
