苹果腐烂病全年均可发病，但有两个明显发病高峰期，一是3—4月，二是9—10月。夏季高温多雨时，若果园湿度大、树体伤口多，也可能局部发病，建议按照以下措施进行防治。
加强管理。及时修剪过密枝条，改善树冠通风透光条件，降低园内湿度，减少病菌滋生条件。避免过量施用氮肥，增施有机肥和磷钾肥，增强树势；雨季及时排水，防止根系积水弱化树体抗病能力。
及时防治。6—7月及时剪除病枝，带出果园集中销毁。对树干伤口及病斑及时处理，用刀刮除病皮至健康组织，涂抹石硫合剂、甲基硫菌灵等药剂进行消毒，再用保护剂封闭创面。6—8月喷施保护性杀菌剂（如波尔多液、代森锰锌等），也可涂抹主干及新生病疤，用戊唑醇10倍液、甲基硫菌灵5倍液、辛菌胺10—50倍液等交替使用。
