“连作障碍”就是在同一田块连续种植同种或同科作物，导致植株出现长势变弱、产量降低、品质下降、病虫害加剧的现象。连作障碍在设施种植中表现尤为突出，成为影响设施种植的难题，如何预防或减轻连作障碍发生。
合理轮作尽量避免同种或同科作物连作，深耕土壤30～40cm，打破浅耕形成的犁底层，促进根系健壮生长。
嫁接换根在番茄、黄瓜等茄果类、瓜类蔬菜生产中，可利用抗性强的砧木进行嫁接，能够有效防治枯萎病、根结线虫病等土传病害的发生。
高温闷棚一般选择6～8月晴天，采用石灰氮—秸秆高温消毒，每亩用生石灰50～100公斤、切碎秸秆1500公斤，深翻30～40厘米，覆膜密封后灌水，连续密闭闷棚15～25天，可有效灭杀多种病原菌和虫卵。
科学施肥避免过量施氮，增施腐熟有机肥和磷钾肥，补充微肥，实施水肥一体化技术，提升土壤有机质含量，改善团粒结构，可解决连作缺素问题，降低盐渍化风险。
补充生物菌剂闷棚结束后或作物生长期，增施木霉菌、枯草芽孢杆菌等有益微生物菌剂，重建健康的根际微生态，防止土传病害的发生。
