冬季，温室黄瓜肥水管理十分重要，如果管理不当，常会造成烂根、沤根、叶片黄化等不良现象，影响黄瓜产量。
施肥要配方施肥，有机肥、复合肥、微肥、活性有益菌肥合理配比。选肥以多元复合肥和有机肥为主，采取底肥和冲施相结合的方法，这样可以活化土层，增加根系延伸的面积，补充植株所需的各种营养元素。温室施肥上要少而精，切不可底肥过多，否则会造成烧苗。冲施肥量也不可过大，否则容易引起烂根、沤根等，施肥时要掌握适量，并且冲施肥料过后，要及时中耕。
在浇水上，冬季温室黄瓜应选择在晴天上午浇水，这时候水温与地温较接近，地温容易提升，而且下午还有充分排湿的时间，尽量避免在傍晚和连阴天的时候浇水，以免引起蔬菜病害的大发生。浇水量不要过大，否则土壤易缺氧而引起根系窒息烂根。浇水最好选择地下水，水温不能低于3℃，并且水量要小，浇水当天，要采取措施尽快恢复地温。同时，还要尽量排湿，如果湿度过大，很容易引发霜霉病和白粉病。